任何一门学说，只要它是合理的，就会有自己因此而成了自己、因此而有别于它者的理论体系和方法体系。自医学也是这样。

一、理论体系

自医学的理论体系包括它的“对象”、“定义”、“立足点”、“内容”以及“特点”。

自医学的对象：

自医学以人体的整体性、有机性、自觉性、自医性以及人体与环境的统一性为对象。

自医学的定义：

自医学是关于人体自医的医学学说。

自医学的立足点：

自医学的立足点是人体的肉体本性、意识本质、精神本体、自医本能以及人体与其生存环境的统一性。

自医学的内容：

自医学由“人体本能自医学”、“人体主动自医学”、“人体环境自医学”共三个部分构成。其中，人体本能自医学包括人体构造理论、人体自医能力理论、人体自医机制理论等;人体主动自医学包括主动自医的人体客观基础理论、人体对自身的主动认知和主动把握的理论，素质自养—功能自健—疾病自愈的理论等;人体环境自医学包括人体受环境决定的理论、人体对环境主动改造的理论、特别是环境对人体具有增强抑或破坏其自医能力的理论等。

人体本能自医学与人体主动自医学、与人体环境自医学的区别是明显的。比如，它们既有本能与主动这一根本性质上的区别，又有前者只有“自医力”、不存在“自医法”而后两者主要研究自医法这种基本内容上的区别。

自医学的特点：

自医学的特点是，尊重造物主赋予人体的肉体本性、意识本质、灵魂本体和自医本能，把健康、疾病和寿命交给人体自身固有的本能自医能力、主动自医能力和环境自医能力;充分尊重、全面调动、合理应用人体的各个器官及其各种功能和协调性;坚持环境在人体健康中的基础地位;坚持人的灵魂状况、心理作用和情绪状态在人体健康中起有决定性的作用;不断发掘人体的自医潜能、充分发挥人体的自医功能、深入探究人体的自医机理，以及认真搜集、甄别和完善人体自医的方法。

二、方法体系

自医学的方法体系包括自医法的“理论基础”、“对象”、“体系”、“判断标准”、“分类”和“局限”。 

自医法的理论基础分为基本原理和具体理论两个部分。

基本原理：

(1)“动作宇宙精神力，静得宇宙精神禅”；

(2)“精神、意识、身体之间的决定—反决定原理”;

具体理论包括：

(1)“速度、力度和量度能够改变质量”，

(2)“放松、向圆和缓慢能够修复功能”，

(3)“情绪、境界和文化能够改变生理”。

自医法的对象：

(1)适合自医法的人群;

(2)相信通过自养法能够保持健康、通过自健法能够恢复健康、通过自愈法能够回到健康的人群;

(3)践行自医法的人群。

自医法的体系：

自医法的体系由本能自医力系统和主动自医法系统这两大系统组成。

自医法的判断标准：

(1)有没有自医效果;

(2)属于自养、自健、自愈中的哪个领域;

(3)是不是体现、保护和增强人体的构造特点、人体的具体功能和人体在不同年龄段的特点。

自医法的分类：

(1)自医法在性质上分普通自医法、特殊自医法、探索中的自医法三种;

(2)自医法在领域上分自养法、自健法、自愈法三个;

(3)自医法在类别上分身体自医法和精神自医法两大类，其中身体自医法又分整体自医法、脏器自医法、关节自医法、针对性自医法、特殊自医法(比如借助专门器材的自医方法，由他人协助自己的自医方法)五种;

(4)自医法在形式上分为力量型自医法、轻柔型自医法和精神型自医法三种。

自医法的局限：

(1)重度精神病患者;

(2)危重到无法做到如“行走自医法”、“蹲起自医法”的患者，如植物人;

(3)严重的大出血患者如骨折、外伤、产后大出血、脏器出血等;

(4)质疑和反对自医学理论和自医法效果的人群。