从最一般的意义上讲，自医学为我们提供了五大原理：

一 自医学的“学说立足点原理”

自医学把“人体的整体性、有机性、自觉性、自医性以及人体与生存环境的统一性”作为自己的立足点，相信一个人只要坚守这个立足点、坚持自医即坚持无病自养、体弱自健、有病自愈，就能健康快乐的度过一生。

二 自医学的“人体构成论原理”

自医学把人体界定为由身体(这是人体中的载体)、意识(这是人体中的介体)、精神(这是人体中的本体)这三个基本部分，按照“决定-反决定法则”统一而成的有机整体。

三 自医学的“人体双自医原理”

自医学是把人体中与生俱来的自医能力、自医机制(即自医本能)作为自己的基础课题。

这一课题构成了本能自医学的基本内容;更为重要的是，自医学还把人类独自具有的“自觉能力、能动能力”应用于人体自医之中，把人类在自医实践中总结出来的、能够唤醒新的自医本能和提高本能自医水平的主动自医理论和主动自医方法，作为自己的主要课题，这一课题构成了主动自医学的根本内容。因此，自医学通过自己的本能自医学和主动自医学以及环境自医学，展现出了有别于古今中外所有其它医学的独特形象。

四 自医学的“人体反过度原理”

自医学把人体的健康与健壮、精力与体力、快乐与快感等严格区别开来，把比如 “过度保养”、“过度保健”、“过度锻炼”、“过度用药”以及“过度劳动”、“过度使用人体的某一机能”，看作是破坏人体本有功能、缩短人体寿命过程、损害人体自医能力的行为，主张人的一切活动都要从人体本有的结构、功能和限度出发，都要以顺应和有益于人体的本有能力为健康标准。

五 自医学的“学科文化性原理”

自医学把“章韶华学术思想体系”作为自己的思维背景、理论基础和思想指导，同时也把自己视为这个学术思想体系中的重要组成部分;这句话的真实意思是，必须把医学放到包括医学在内的由科学、人学、哲学、灵学、神学等学科基础成果组成的“人类整个知识体系”中来解释和建构，即把医学作为一种文化模式来解释和建构。